Análisis filogenético del virus de Hepatitis A genotipo IA en Argentina

Resumen

En Argentina, la introducción de la vacuna generó cambios en la epidemiología del virus de la hepatitis A (HAV), destacando la necesidad de monitorear las cepas virales circulantes. Este estudio plantea analizar las relaciones filogenéticas de las cepas de HAV en Córdoba-Argentina para una mejor comprensión de su dinámica de circulación.

Se analizaron 78 muestras clínicas y 109 de aguas residuales RNA-HAV+, colectadas en Córdoba-Argentina entre 2016-2023, por dos RT-Nested-PCRs dirigidas a la región VP1/2A y posterior secuenciación (Sanger). Se construyeron dos bases de datos (BD) con secuencias de HAV genotipo IA de los dos fragmentos amplificados: BD-A con 531 secuencias (300pb) y BD-B con 119 secuencias (900pb). Ambos incluyeron las secuencias obtenidas en este estudio (n=47); todos los aislamientos de Argentina y Latinoamérica publicados anteriormente; las primeras cinco secuencias obtenidas de la búsqueda de BLAST con secuencias de este estudio; y secuencias IA de referencia. Los análisis filogenéticos se realizaron con IQ-TREE-v2.1.

Los resultados de ambas BD fueron similares, revelando que los aislamientos de HAV formaron dos agrupamientos principales. El grupo más grande contiene secuencias de brotes europeos y latinoamericanos en hombres que tienen sexo con hombres (HSH) y aislamientos de Córdoba (del brote local de HSH de 2017-2019, de casos ocurridos en 2022-2023 y de aguas residuales de los mismos años). Dentro de este clado, las secuencias de Córdoba se agruparon en tres grupos según diferentes períodos (2017-2018; 2018-2019; 2022-2023), lo que indica que la cepa responsable del  brote se habría establecido en la región desde 2017 con pequeñas variaciones anuales. El segundo clado incluyó secuencias de este estudio y cepas previas endémicas argentinas de diferentes regiones, fuentes y años. El resto de las secuencias obtenidas agruparon entremezcladas con secuencias globales y correspondieron a cepas importadas de viajeros a países latinoamericanos.

Nuestros hallazgos resaltan la diversidad de cepas HAV-IA en Argentina, sugiriendo la introducción de nuevas variantes de regiones geográficamente distantes y su potencial propagación a la población local. Se enfatiza la importancia de los enfoques filogenéticos para monitorear la dinámica de circulación de HAV, rastrear el origen de los brotes y respaldar medidas de salud pública.