Desarrollo de nuevos loci de microsatélites para Geoffroea decorticans (Gillies ex Hook. & Arn.) Burkart

Autores/as

  • Roberto César Contreras Diaz Universidad de Atacama http://orcid.org/0000-0002-5607-811X
  • Felipe Carevic Vergara Laboratorio de Ecología Vegetal, Facultad de Recursos Naturales Renovables. Universidad Arturo Prat, Campus Huayquique, Iquique, Chile.
  • Mariana Arias Aburto Centro Regional de Investigación y Desarrollo Sustentable de Atacama (CRIDESAT), Universidad de Atacama, Copayapu 485, Copiapó, Chile.
  • Wilson Huanca Mamani Laboratorio de Biología Molecular de Plantas, Facultad de Ciencias Agronómicas, Universidad de Tarapacá, Arica, Chile.
  • Bladimir Díaz Martín Centro Regional de Investigación y Desarrollo Sustentable de Atacama (CRIDESAT), Universidad de Atacama, Copayapu 485, Copiapó, Chile.

DOI:

https://doi.org/10.31055/1851.2372.v56.n4.32721

Palabras clave:

Desierto de Atacama, diversidad genética, Geoffroea decorticans, marcadores SSR, next-generation sequencing

Resumen

Introducción y objetivos: Una de las pocas especies de árboles adaptados a las condiciones ecológicamente limitantes del desierto de Atacama es Geoffroea decorticans, conocido como chañar. Es un valioso recurso multipropósito utilizado como alimento y producto medicinal. Sin embargo, aún no se han desarrollado marcadores de ADN codominantes específicos para esta especie que permitan realizar estudios genéticos en la especie. El objetivo del presente trabajo fue desarrollar y validar marcadores microsatélites (SSR) para G. decorticans, con el fin de analizar en el futuro su diversidad genética y estructura genética poblacional.

M&M: Se buscaron marcadores SSR en el genoma de G. decorticans a partir del método Next-Generation Sequencing (NGS), y se validaron a través de treinta individuos distribuidos en diferentes localidades del norte de Chile.

Resultados: Se identificó un total de ~144.117 loci de microsatélites y de ellos se usó un grupo de 41 pares de cebadores para la validación. Los fragmentos amplificados variaron de 106 pb a 225 pb, el número de alelos varió de 2 a 9, y el valor PIC de los 41 loci SSR osciló entre 0,32 y 0,86, con un promedio de 0,64.

Conclusiones: Por primera vez se desarrollaron marcadores SSR putativamente neutros específicos de la especie G. decorticans con el fin de promover estudios genéticos para la conservación de la especie. El presente estudio provee 38 nuevos marcadores SSR polimórficos, los cuales podrían servir como una herramienta efectiva para estimar la diversidad genética, estructura genética y para ser empleados en programas de mejora.

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Biografía del autor/a

Roberto César Contreras Diaz, Universidad de Atacama

Investigador, Académico-Instructor, CRIDESAT- Universidad de Atacama

Citas

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Publicado

2021-12-22

Cómo citar

Contreras Diaz, Roberto César, Felipe Carevic Vergara, Mariana Arias Aburto, Wilson Huanca Mamani, y Bladimir Díaz Martín. 2021. «Desarrollo De Nuevos Loci De microsatélites Para Geoffroea Decorticans (Gillies Ex Hook. & Arn.) Burkart». Boletín De La Sociedad Argentina De Botánica 56 (4). https://doi.org/10.31055/1851.2372.v56.n4.32721.

Número

Sección

Genética & Evolución